Izvještaj desetog JC-a od 18.11.2025., GAbridge projekt

 

Deseti journal club u sklopu Gabridge projekta održao se u utorak, 18.11.2025. Doktorandica Ivana Keršić prezentirala je rad "Inferring Domestic Goat Demographic History Through Ancient Genome Imputation" (Erven et al., 2025). Rad je važan istraživačkoj grupi jer u detalje prolazi kroz postupak imputacije na drevnim genomima domaće životinje (koze), metoda koju želimo implementirati u naš rad s drevnim sekvencama. Raspravljalo se o utjecaju pojedinih parametara te koji pristup bi bio najbolji za naše potrebe te se opet istaknula važnost sklapanja kvalitetnog referentnog seta podataka - u ovom slučaju, validacijskog seta podataka za imputaciju. Iz rada smo zaključili kako ćemo za potrebe daljnjeg rada trebati koristiti GLIMPSE program za imputaciju te koje vrijednosti parametara koristiti kod analize u programu.