MitoTAUROmics

Iskorištavanje informacije cijelog mitohondrijskog genoma u oplemenjivanju i konzervacijskoj genetici goveda

Glavni cilj ovog projekta je sekvenciranje cjelokupnog mitohondrijskog genoma (mtWGS) u 500 do 600 bikova ili krava (440 do 540 pripadaju istarskom govedu, govedu buša, slavonsko-srijemskom podolskom govedu i populaciji holsteina u Hrvatskoj). Cilj je: 1) identificirati polimorfna mjesta unutar mtWGS-a u genetski malim populacijama i analizirati (potvrditi) prisutnost selekcije za cijeli genom mitohondrija i za svaki pojedinačni gen (uspoređujući nesinonimne sa sinonimnim mutacijama); 2) identificirati potencijalno štetne mutacije i procijeniti štetno opterećenje u svim analiziranim populacijama; 3) razviti računalni pristup (skup algoritama) koji omogućava, u smislu vjerojatnosti, imputiranje sekvenciranih haplotipova mtWGS za ostale članove filogenetskog stabla, kao i isticanje životinja koje su pogrešno postavljene u filogenetskom stablu 4) identificirati mutacije povezane s fenotipskom varijabilnošću u proizvodnji mlijeka i svojstvima plodnosti te procjenu veličine učinaka mtWGS (haplotipova) u smislu komponenata varijance i 5) identificiarti specifične mutacije koje se mogu koristiti za genetsko barkodiranje vrsta i pasmina (to je od posebnog interesa za ugrožene populacije). U provođenju ovih sveobuhvatnih analiza koristit ćemo se novorazvijenim visokopropusnim metodama sekvenciranja i složenim računalnim analizama. Vjerujemo da će ovo istraživanje potaknuti druge istraživače koji se bave genetikom životinja i uzgojem drugih vrsta (pas, konj, svinja, zec itd.) na provođenje sličnih istraživanja. Štoviše, rezultati projekta koristit će se komercijalno i u uzgoju stoke i u upravljanju očuvanjem ugroženih hrvatskih pasmina. Istodobno se nadamo da će inovativna i tehnološki napredna komponenta ovog istraživanja dovesti do objavljivanja dobrih radova svih uključenih znanstvenika što će dodatno povećati našu konkurentnost prilikom prijavljivanja na projekte koje financira EU.

Prijava korisnika

Mrežna stranica koristi kolačiće (cookies). Kolačiće upotrebljavamo kako bismo personalizirali sadržaj i oglase, omogućili značajke društvenih medija i analizirali promet. Isto tako, podatke o vašoj upotrebi naše web-lokacije dijelimo s partnerima za društvene medije, oglašavanje i analizu, a oni ih mogu kombinirati s drugim podacima koje ste im pružili ili koje su prikupili dok ste upotrebljavali njihove usluge. Nastavkom korištenja naših internetskih stranica vi prihvaćate našu upotrebu kolačića. Polica privatnosti.